普圓精舍主要殿堂位於地下一樓，大門入口處高掛導師 上惟下覺大和尚德相，並設有結緣書櫃，由此往下即進入心靈的桃花源──一個莊嚴清淨的禪修世界。
沿著樓梯進入地下一樓，首先映入眼簾的是知客室，法師們及照客菩薩親切接待來訪信眾，並提供精舍活動、課程等資訊，讓大眾可了解精舍的弘法概況。
大雄寶殿
「大雄寶殿」是佛教叢林道場中供奉佛像的正殿。諸佛如來具大功德力，降伏魔怨，故稱「大雄」。普圓精舍大雄寶殿內供奉五尊佛像，中間三尊分別為釋迦牟尼佛、最勝吉祥如來及寶月智嚴王如來；右側為藥師佛，左側為阿彌陀佛。兩旁則供奉有十八羅漢及觀音菩薩光明燈，提供大眾常年點燈供佛。此處亦為精舍舉辦法會時之消災超薦壇。
禪堂
位於精舍後方的禪堂，提供平日禪修課程活動或大法會所使用的場地。禪堂內供奉本師釋迦牟尼佛。整體的空間，以木材的質感架構而成，柔和的燈光映照著木質地板，予人莊嚴安詳的感覺，讓人進入禪堂即為沉靜的環境所攝受，澄思絕慮，心境清涼。
齋堂及圖書館
齋堂是大眾用餐的地方，中間供奉笑口常開的彌勒菩薩，祈願來精舍用齋的菩薩，都能吃得歡喜、自在。大寮香積菩薩所用心準備的美味佳餚素齋，更是普圓精舍的一大特色，普願「法輪未轉，食輪先轉」。
齋堂一側，同時設有書櫃，收存有大藏經、佛教各宗典籍、佛教藝術書籍、傳記及講述倫理道德之兒童讀物等豐富典籍，並有中台山出版之影音視訊影片，如自在步紅塵、中台寶光等影帶及VCD，學員可在此閱讀經典、搜尋資料、借閱圖書。
會議室
此處為精舍接待訪客與召開小型會議集思廣益的地方，典雅簡約的設計，每令來者心生歡喜。
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知客室 |
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大雄寶殿 |
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禪堂 |
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齋堂及圖書館 |
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會議室 |